Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COX4I1P13073 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COX4I1P13073 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COX4I1P13073 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms