Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP4P12644 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP4P12644 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP4P12644 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP4P12644 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP4P12644 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP4P12644 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP4P12644 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP4P12644 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BMP4P12644 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP4P12644 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP4P12644 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP4P12644 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP4P12644 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP4P12644 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP4P12644 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP4P12644 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP4P12644 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP4P12644 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP4P12644 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP4P12644 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP4P12644 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP4P12644 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP4P12644 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP4P12644 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP4P12644 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP4P12644 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP4P12644 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP4P12644 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP4P12644 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP4P12644 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP4P12644 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP4P12644 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP4P12644 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP4P12644 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP4P12644 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP4P12644 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP4P12644 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BMP4P12644 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BMP4P12644 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP4P12644 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP4P12644 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP4P12644 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP4P12644 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP4P12644 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP4P12644 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP4P12644 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP4P12644 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP4P12644 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP4P12644 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP4P12644 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP4P12644 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP4P12644 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP4P12644 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP4P12644 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP4P12644 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP4P12644 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP4P12644 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP4P12644 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP4P12644 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP4P12644 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMP4P12644 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP4P12644 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP4P12644 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP4P12644 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP4P12644 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMP4P12644 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP4P12644 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP4P12644 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BMP4P12644 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP4P12644 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP4P12644 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP4P12644 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP4P12644 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP4P12644 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BMP4P12644 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP4P12644 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP4P12644 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP4P12644 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP4P12644 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP4P12644 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP4P12644 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP4P12644 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP4P12644 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP4P12644 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP4P12644 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP4P12644 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP4P12644 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms