Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRP12270 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRP12270 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRP12270 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRP12270 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRP12270 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRP12270 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRP12270 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRP12270 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRP12270 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRP12270 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRP12270 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRP12270 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRP12270 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRP12270 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPRP12270 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRP12270 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRP12270 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRP12270 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRP12270 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPRP12270 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRP12270 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRP12270 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRP12270 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPRP12270 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPRP12270 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPRP12270 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRP12270 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRP12270 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRP12270 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRP12270 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRP12270 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPRP12270 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRP12270 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRP12270 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRP12270 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPRP12270 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRP12270 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRP12270 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRP12270 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TPRP12270 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRP12270 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPRP12270 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRP12270 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRP12270 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRP12270 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRP12270 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRP12270 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRP12270 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRP12270 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRP12270 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRP12270 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRP12270 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRP12270 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRP12270 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRP12270 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRP12270 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRP12270 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRP12270 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRP12270 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRP12270 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRP12270 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPRP12270 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRP12270 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRP12270 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRP12270 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRP12270 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRP12270 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRP12270 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRP12270 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRP12270 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRP12270 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRP12270 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRP12270 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRP12270 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRP12270 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRP12270 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRP12270 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRP12270 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRP12270 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRP12270 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRP12270 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRP12270 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPRP12270 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms