Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AppP12023 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AppP12023 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AppP12023 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AppP12023 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AppP12023 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AppP12023 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AppP12023 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AppP12023 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AppP12023 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AppP12023 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AppP12023 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AppP12023 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AppP12023 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
AppP12023 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AppP12023 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AppP12023 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AppP12023 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AppP12023 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AppP12023 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AppP12023 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AppP12023 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AppP12023 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AppP12023 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AppP12023 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AppP12023 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AppP12023 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AppP12023 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AppP12023 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AppP12023 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AppP12023 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AppP12023 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AppP12023 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AppP12023 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AppP12023 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AppP12023 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AppP12023 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AppP12023 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AppP12023 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AppP12023 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AppP12023 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AppP12023 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AppP12023 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AppP12023 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AppP12023 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AppP12023 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AppP12023 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AppP12023 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AppP12023 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AppP12023 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AppP12023 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AppP12023 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AppP12023 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AppP12023 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
AppP12023 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AppP12023 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AppP12023 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AppP12023 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AppP12023 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AppP12023 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AppP12023 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AppP12023 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AppP12023 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AppP12023 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AppP12023 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AppP12023 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AppP12023 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AppP12023 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AppP12023 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AppP12023 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AppP12023 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AppP12023 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AppP12023 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AppP12023 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AppP12023 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AppP12023 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AppP12023 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AppP12023 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AppP12023 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AppP12023 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AppP12023 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AppP12023 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AppP12023 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AppP12023 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
AppP12023 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AppP12023 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AppP12023 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AppP12023 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AppP12023 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AppP12023 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AppP12023 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AppP12023 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AppP12023 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AppP12023 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AppP12023 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AppP12023 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AppP12023 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
AppP12023 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AppP12023 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AppP12023 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms