Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD1P11586 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD1P11586 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFD1P11586 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms