Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DMDP11532 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DMDP11532 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DMDP11532 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DMDP11532 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMDP11532 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMDP11532 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMDP11532 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMDP11532 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DMDP11532 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DMDP11532 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DMDP11532 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DMDP11532 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DMDP11532 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DMDP11532 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DMDP11532 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DMDP11532 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DMDP11532 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DMDP11532 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DMDP11532 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DMDP11532 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DMDP11532 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DMDP11532 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DMDP11532 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DMDP11532 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DMDP11532 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DMDP11532 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DMDP11532 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DMDP11532 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DMDP11532 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DMDP11532 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DMDP11532 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DMDP11532 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DMDP11532 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DMDP11532 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DMDP11532 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DMDP11532 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMDP11532 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DMDP11532 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DMDP11532 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DMDP11532 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DMDP11532 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DMDP11532 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DMDP11532 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DMDP11532 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DMDP11532 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DMDP11532 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DMDP11532 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DMDP11532 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DMDP11532 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DMDP11532 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DMDP11532 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DMDP11532 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DMDP11532 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DMDP11532 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DMDP11532 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DMDP11532 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DMDP11532 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DMDP11532 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DMDP11532 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DMDP11532 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DMDP11532 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DMDP11532 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DMDP11532 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DMDP11532 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DMDP11532 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DMDP11532 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DMDP11532 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DMDP11532 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DMDP11532 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DMDP11532 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DMDP11532 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DMDP11532 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DMDP11532 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DMDP11532 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DMDP11532 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DMDP11532 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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