Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk1P11440 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk1P11440 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk1P11440 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms