Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHGAP10645 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CHGAP10645 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHGAP10645 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHGAP10645 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHGAP10645 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CHGAP10645 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHGAP10645 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHGAP10645 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHGAP10645 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHGAP10645 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CHGAP10645 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHGAP10645 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHGAP10645 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHGAP10645 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHGAP10645 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHGAP10645 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHGAP10645 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CHGAP10645 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHGAP10645 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHGAP10645 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHGAP10645 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHGAP10645 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHGAP10645 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHGAP10645 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHGAP10645 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHGAP10645 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHGAP10645 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHGAP10645 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CHGAP10645 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHGAP10645 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CHGAP10645 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CHGAP10645 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHGAP10645 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHGAP10645 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHGAP10645 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHGAP10645 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CHGAP10645 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHGAP10645 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHGAP10645 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHGAP10645 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHGAP10645 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CHGAP10645 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHGAP10645 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHGAP10645 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CHGAP10645 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHGAP10645 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHGAP10645 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHGAP10645 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHGAP10645 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHGAP10645 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHGAP10645 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CHGAP10645 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHGAP10645 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHGAP10645 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CHGAP10645 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHGAP10645 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHGAP10645 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHGAP10645 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHGAP10645 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CHGAP10645 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CHGAP10645 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHGAP10645 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHGAP10645 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHGAP10645 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHGAP10645 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHGAP10645 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHGAP10645 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHGAP10645 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHGAP10645 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHGAP10645 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHGAP10645 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHGAP10645 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHGAP10645 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHGAP10645 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHGAP10645 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CHGAP10645 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHGAP10645 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHGAP10645 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHGAP10645 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHGAP10645 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHGAP10645 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHGAP10645 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHGAP10645 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHGAP10645 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHGAP10645 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHGAP10645 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHGAP10645 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHGAP10645 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHGAP10645 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHGAP10645 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHGAP10645 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHGAP10645 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHGAP10645 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHGAP10645 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHGAP10645 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHGAP10645 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CHGAP10645 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHGAP10645 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHGAP10645 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms