Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETSIPP0DME0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETSIPP0DME0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETSIPP0DME0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms