Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49P0CI25 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49P0CI25 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM49P0CI25 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49P0CI25 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms