Protein–RNA interactions for Protein: P0C090

Rc3h2, Roquin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rc3h2P0C090 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rc3h2P0C090 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rc3h2P0C090 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rc3h2P0C090 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rc3h2P0C090 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147 ms