Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXB7P09629 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HOXB7P09629 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HOXB7P09629 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms