Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa5P09021 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxa5P09021 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms