Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPAP09012 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPAP09012 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPAP09012 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms