Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRAP08240 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPRAP08240 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRAP08240 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms