Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a2P08122 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col4a2P08122 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a2P08122 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a2P08122 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms