Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM2P07951 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM2P07951 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM2P07951 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM2P07951 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM2P07951 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM2P07951 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM2P07951 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM2P07951 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM2P07951 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM2P07951 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM2P07951 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM2P07951 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM2P07951 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM2P07951 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM2P07951 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM2P07951 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM2P07951 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM2P07951 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM2P07951 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM2P07951 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM2P07951 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM2P07951 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM2P07951 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM2P07951 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM2P07951 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM2P07951 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM2P07951 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM2P07951 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM2P07951 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM2P07951 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM2P07951 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM2P07951 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM2P07951 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM2P07951 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM2P07951 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM2P07951 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM2P07951 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM2P07951 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TPM2P07951 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM2P07951 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM2P07951 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM2P07951 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM2P07951 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM2P07951 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM2P07951 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM2P07951 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM2P07951 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM2P07951 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM2P07951 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM2P07951 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPM2P07951 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPM2P07951 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPM2P07951 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPM2P07951 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TPM2P07951 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TPM2P07951 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPM2P07951 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPM2P07951 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM2P07951 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM2P07951 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM2P07951 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM2P07951 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TPM2P07951 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TPM2P07951 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TPM2P07951 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TPM2P07951 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TPM2P07951 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPM2P07951 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPM2P07951 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPM2P07951 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TPM2P07951 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPM2P07951 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPM2P07951 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPM2P07951 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM2P07951 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM2P07951 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM2P07951 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM2P07951 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM2P07951 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM2P07951 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM2P07951 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPM2P07951 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPM2P07951 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPM2P07951 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPM2P07951 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms