Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG5P05408 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG5P05408 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG5P05408 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG5P05408 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG5P05408 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG5P05408 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG5P05408 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG5P05408 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG5P05408 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG5P05408 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG5P05408 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG5P05408 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG5P05408 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG5P05408 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG5P05408 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG5P05408 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG5P05408 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG5P05408 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG5P05408 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCG5P05408 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG5P05408 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG5P05408 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCG5P05408 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG5P05408 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG5P05408 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG5P05408 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG5P05408 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG5P05408 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG5P05408 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCG5P05408 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG5P05408 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG5P05408 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG5P05408 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG5P05408 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG5P05408 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG5P05408 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG5P05408 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG5P05408 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG5P05408 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG5P05408 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG5P05408 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG5P05408 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG5P05408 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG5P05408 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG5P05408 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG5P05408 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG5P05408 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG5P05408 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG5P05408 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG5P05408 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG5P05408 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG5P05408 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG5P05408 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG5P05408 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG5P05408 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG5P05408 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG5P05408 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG5P05408 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG5P05408 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG5P05408 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG5P05408 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG5P05408 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG5P05408 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG5P05408 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG5P05408 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG5P05408 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG5P05408 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG5P05408 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG5P05408 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG5P05408 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG5P05408 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG5P05408 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG5P05408 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG5P05408 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG5P05408 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG5P05408 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG5P05408 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG5P05408 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG5P05408 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms