Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1P04632 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1P04632 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms