Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QAP02745 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QAP02745 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QAP02745 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QAP02745 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QAP02745 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QAP02745 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QAP02745 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QAP02745 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QAP02745 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QAP02745 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QAP02745 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QAP02745 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QAP02745 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QAP02745 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QAP02745 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QAP02745 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QAP02745 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QAP02745 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QAP02745 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QAP02745 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QAP02745 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QAP02745 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QAP02745 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QAP02745 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QAP02745 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QAP02745 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QAP02745 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QAP02745 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QAP02745 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QAP02745 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QAP02745 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QAP02745 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QAP02745 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QAP02745 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QAP02745 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QAP02745 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QAP02745 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QAP02745 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1QAP02745 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QAP02745 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QAP02745 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QAP02745 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QAP02745 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QAP02745 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QAP02745 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QAP02745 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QAP02745 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QAP02745 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QAP02745 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QAP02745 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QAP02745 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QAP02745 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QAP02745 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QAP02745 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QAP02745 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QAP02745 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QAP02745 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QAP02745 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QAP02745 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QAP02745 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QAP02745 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QAP02745 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QAP02745 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QAP02745 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1QAP02745 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QAP02745 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms