Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA1P02708 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNA1P02708 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA1P02708 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA1P02708 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms