Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNAP02545 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNAP02545 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNAP02545 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNAP02545 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNAP02545 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNAP02545 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNAP02545 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNAP02545 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNAP02545 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNAP02545 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNAP02545 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNAP02545 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNAP02545 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNAP02545 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNAP02545 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNAP02545 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNAP02545 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNAP02545 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNAP02545 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNAP02545 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNAP02545 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNAP02545 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNAP02545 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNAP02545 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNAP02545 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNAP02545 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNAP02545 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNAP02545 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNAP02545 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNAP02545 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNAP02545 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNAP02545 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNAP02545 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNAP02545 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNAP02545 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNAP02545 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNAP02545 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNAP02545 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNAP02545 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNAP02545 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNAP02545 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNAP02545 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNAP02545 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNAP02545 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNAP02545 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNAP02545 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNAP02545 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNAP02545 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNAP02545 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNAP02545 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNAP02545 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNAP02545 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNAP02545 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNAP02545 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNAP02545 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNAP02545 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNAP02545 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNAP02545 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNAP02545 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNAP02545 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms