Protein–RNA interactions for Protein: P02088

Hbb-b1, Hemoglobin subunit beta-1, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-b1P02088 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-b1P02088 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b1P02088 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b1P02088 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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