Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01797 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01797 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01797 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01797 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01797 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01797 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01797 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01797 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01797 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01797 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01797 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01797 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01797 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01797 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01797 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01797 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01797 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01797 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01797 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01797 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01797 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01797 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01797 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01797 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01797 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01797 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01797 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01797 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01797 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01797 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01797 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01797 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01797 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01797 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01797 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01797 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01797 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01797 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01797 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01797 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01797 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01797 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01797 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01797 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01797 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01797 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01797 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01797 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01797 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01797 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01797 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01797 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01797 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01797 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01797 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01797 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01797 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01797 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01797 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01797 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01797 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01797 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01797 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01797 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01797 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01797 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms