Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01673 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01673 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01673 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01673 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01673 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01673 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01673 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01673 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01673 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01673 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P01673 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01673 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01673 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01673 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01673 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01673 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01673 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01673 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01673 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01673 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01673 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01673 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01673 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01673 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01673 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01673 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01673 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01673 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01673 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01673 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01673 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01673 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01673 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01673 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01673 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01673 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01673 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01673 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01673 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01673 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01673 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01673 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01673 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01673 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01673 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01673 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01673 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01673 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01673 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01673 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01673 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01673 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01673 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01673 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01673 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01673 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01673 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01673 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01673 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01673 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01673 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01673 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01673 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P01673 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01673 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01673 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01673 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01673 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01673 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01673 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01673 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P01673 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01673 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01673 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01673 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01673 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01673 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01673 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms