Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01641 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01641 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01641 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01641 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01641 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01641 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01641 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01641 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01641 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01641 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P01641 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01641 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01641 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01641 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01641 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01641 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01641 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01641 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01641 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01641 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01641 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01641 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01641 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01641 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01641 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01641 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01641 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01641 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01641 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P01641 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01641 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01641 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01641 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01641 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01641 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01641 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01641 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P01641 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01641 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01641 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01641 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01641 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01641 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01641 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01641 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01641 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01641 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01641 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01641 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01641 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01641 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01641 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01641 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01641 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01641 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01641 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01641 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01641 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01641 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01641 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01641 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P01641 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01641 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01641 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01641 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01641 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01641 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01641 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01641 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01641 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01641 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01641 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01641 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01641 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01641 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01641 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01641 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01641 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01641 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01641 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01641 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01641 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01641 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01641 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01641 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01641 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01641 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01641 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms