Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX11BO96011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX11BO96011 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX11BO96011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX11BO96011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms