Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
S1PR4O95977 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
S1PR4O95977 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
S1PR4O95977 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms