Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLR1AO95602 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLR1AO95602 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLR1AO95602 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
POLR1AO95602 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms