Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LETM1O95202 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LETM1O95202 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LETM1O95202 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LETM1O95202 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LETM1O95202 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LETM1O95202 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LETM1O95202 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LETM1O95202 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LETM1O95202 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LETM1O95202 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LETM1O95202 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LETM1O95202 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LETM1O95202 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LETM1O95202 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LETM1O95202 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LETM1O95202 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LETM1O95202 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LETM1O95202 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LETM1O95202 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LETM1O95202 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LETM1O95202 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LETM1O95202 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LETM1O95202 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LETM1O95202 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LETM1O95202 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LETM1O95202 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LETM1O95202 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LETM1O95202 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LETM1O95202 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LETM1O95202 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LETM1O95202 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LETM1O95202 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LETM1O95202 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LETM1O95202 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LETM1O95202 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LETM1O95202 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LETM1O95202 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LETM1O95202 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LETM1O95202 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LETM1O95202 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LETM1O95202 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LETM1O95202 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LETM1O95202 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LETM1O95202 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LETM1O95202 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LETM1O95202 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LETM1O95202 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LETM1O95202 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LETM1O95202 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LETM1O95202 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LETM1O95202 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LETM1O95202 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LETM1O95202 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LETM1O95202 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LETM1O95202 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LETM1O95202 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LETM1O95202 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LETM1O95202 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LETM1O95202 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LETM1O95202 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LETM1O95202 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LETM1O95202 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LETM1O95202 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LETM1O95202 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LETM1O95202 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LETM1O95202 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LETM1O95202 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LETM1O95202 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LETM1O95202 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LETM1O95202 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LETM1O95202 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LETM1O95202 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LETM1O95202 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LETM1O95202 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LETM1O95202 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LETM1O95202 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LETM1O95202 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms