Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SOGA1O94964 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
SOGA1O94964 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SOGA1O94964 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.35
SOGA1O94964 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
SOGA1O94964 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms