Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CNTN5O94779 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN5O94779 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN5O94779 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN5O94779 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN5O94779 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms