Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc6O88978 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc6O88978 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc6O88978 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms