Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BlmO88700 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BlmO88700 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BlmO88700 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
BlmO88700 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BlmO88700 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
BlmO88700 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BlmO88700 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BlmO88700 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BlmO88700 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BlmO88700 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
BlmO88700 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
BlmO88700 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
BlmO88700 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BlmO88700 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BlmO88700 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BlmO88700 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
BlmO88700 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BlmO88700 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BlmO88700 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BlmO88700 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BlmO88700 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BlmO88700 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BlmO88700 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BlmO88700 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BlmO88700 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BlmO88700 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BlmO88700 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BlmO88700 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BlmO88700 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BlmO88700 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BlmO88700 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BlmO88700 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BlmO88700 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BlmO88700 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BlmO88700 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BlmO88700 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BlmO88700 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BlmO88700 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BlmO88700 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BlmO88700 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BlmO88700 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BlmO88700 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BlmO88700 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
BlmO88700 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BlmO88700 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BlmO88700 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
BlmO88700 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
BlmO88700 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BlmO88700 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BlmO88700 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BlmO88700 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BlmO88700 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BlmO88700 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BlmO88700 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BlmO88700 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BlmO88700 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BlmO88700 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
BlmO88700 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
BlmO88700 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BlmO88700 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BlmO88700 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BlmO88700 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BlmO88700 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
BlmO88700 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BlmO88700 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BlmO88700 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BlmO88700 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
BlmO88700 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
BlmO88700 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BlmO88700 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BlmO88700 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BlmO88700 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BlmO88700 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BlmO88700 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BlmO88700 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BlmO88700 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BlmO88700 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BlmO88700 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BlmO88700 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BlmO88700 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BlmO88700 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BlmO88700 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
BlmO88700 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BlmO88700 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35■■■■□ 3.19
BlmO88700 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BlmO88700 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BlmO88700 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BlmO88700 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BlmO88700 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BlmO88700 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
BlmO88700 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BlmO88700 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BlmO88700 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BlmO88700 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BlmO88700 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
BlmO88700 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BlmO88700 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BlmO88700 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
BlmO88700 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms