Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema3fO88632 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3fO88632 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema3fO88632 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3fO88632 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms