Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnnt1O88346 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnnt1O88346 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tnnt1O88346 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tnnt1O88346 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnnt1O88346 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms