Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sorl1O88307 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sorl1O88307 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorl1O88307 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms