Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cfdp1O88271 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfdp1O88271 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfdp1O88271 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfdp1O88271 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cfdp1O88271 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms