Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC22BO75396 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC22BO75396 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC22BO75396 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC22BO75396 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC22BO75396 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC22BO75396 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC22BO75396 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms