Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM24O75264 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM24O75264 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM24O75264 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms