Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp8O70404 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp8O70404 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.2 ms