Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX2O60749 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX2O60749 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX2O60749 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX2O60749 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX2O60749 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX2O60749 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX2O60749 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX2O60749 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX2O60749 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX2O60749 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX2O60749 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX2O60749 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX2O60749 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX2O60749 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX2O60749 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX2O60749 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX2O60749 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX2O60749 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX2O60749 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX2O60749 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX2O60749 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX2O60749 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX2O60749 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX2O60749 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX2O60749 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX2O60749 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX2O60749 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX2O60749 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX2O60749 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX2O60749 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX2O60749 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX2O60749 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX2O60749 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX2O60749 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX2O60749 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX2O60749 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX2O60749 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX2O60749 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX2O60749 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX2O60749 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX2O60749 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX2O60749 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX2O60749 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX2O60749 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX2O60749 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX2O60749 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX2O60749 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX2O60749 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX2O60749 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX2O60749 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX2O60749 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX2O60749 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX2O60749 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX2O60749 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX2O60749 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX2O60749 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX2O60749 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX2O60749 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX2O60749 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX2O60749 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX2O60749 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX2O60749 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX2O60749 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX2O60749 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX2O60749 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX2O60749 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX2O60749 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX2O60749 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX2O60749 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX2O60749 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX2O60749 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX2O60749 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX2O60749 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX2O60749 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX2O60749 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms