Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD1O60671 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD1O60671 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD1O60671 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD1O60671 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD1O60671 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD1O60671 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD1O60671 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD1O60671 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD1O60671 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD1O60671 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD1O60671 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD1O60671 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD1O60671 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD1O60671 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD1O60671 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD1O60671 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD1O60671 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD1O60671 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD1O60671 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD1O60671 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD1O60671 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD1O60671 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD1O60671 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD1O60671 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD1O60671 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD1O60671 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD1O60671 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD1O60671 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD1O60671 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD1O60671 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD1O60671 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD1O60671 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD1O60671 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD1O60671 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD1O60671 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD1O60671 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD1O60671 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD1O60671 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD1O60671 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD1O60671 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD1O60671 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD1O60671 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD1O60671 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD1O60671 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD1O60671 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD1O60671 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD1O60671 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD1O60671 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD1O60671 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD1O60671 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD1O60671 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD1O60671 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD1O60671 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD1O60671 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD1O60671 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD1O60671 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD1O60671 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD1O60671 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD1O60671 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD1O60671 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD1O60671 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD1O60671 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD1O60671 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD1O60671 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD1O60671 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD1O60671 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD1O60671 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD1O60671 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD1O60671 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms