Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD2O60548 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD2O60548 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXD2O60548 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms