Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
PLXNC1O60486 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PLXNC1O60486 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
PLXNC1O60486 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PLXNC1O60486 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PLXNC1O60486 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms