Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms