Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ATP10AO60312 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP10AO60312 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP10AO60312 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP10AO60312 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP10AO60312 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms