Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atp10aO54827 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Atp10aO54827 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atp10aO54827 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atp10aO54827 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atp10aO54827 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atp10aO54827 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atp10aO54827 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Atp10aO54827 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Atp10aO54827 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Atp10aO54827 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Atp10aO54827 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Atp10aO54827 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Atp10aO54827 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atp10aO54827 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atp10aO54827 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atp10aO54827 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Atp10aO54827 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Atp10aO54827 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Atp10aO54827 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Atp10aO54827 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Atp10aO54827 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atp10aO54827 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atp10aO54827 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atp10aO54827 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.1 ms