Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxO54751 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxO54751 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxO54751 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrxO54751 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrxO54751 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrxO54751 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrxO54751 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrxO54751 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrxO54751 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrxO54751 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrxO54751 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrxO54751 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrxO54751 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrxO54751 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrxO54751 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrxO54751 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrxO54751 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrxO54751 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrxO54751 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CrxO54751 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrxO54751 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrxO54751 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrxO54751 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrxO54751 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrxO54751 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxO54751 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxO54751 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxO54751 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxO54751 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxO54751 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxO54751 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxO54751 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxO54751 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxO54751 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxO54751 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxO54751 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxO54751 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxO54751 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxO54751 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxO54751 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxO54751 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxO54751 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxO54751 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxO54751 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxO54751 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxO54751 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxO54751 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxO54751 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxO54751 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxO54751 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxO54751 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxO54751 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxO54751 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxO54751 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxO54751 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxO54751 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxO54751 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxO54751 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxO54751 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxO54751 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms