Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cavin1O54724 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cavin1O54724 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cavin1O54724 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cavin1O54724 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 903 ms